Boas
Acho que a única solução é usares uma pen de arranque para instalares o Windows já com a última build e formatares a tua máquina e instalares tudo de novo.
Eu tenho um Windows 10 num disco externo só para testes numa partição criada nele que foi limpo de metro apps e mais coisas usando o NtLitle e nesse Windows simplesmente não actualiza para a última versão e o Windows update diz que não existem mais actualizações para fazer. Só que em baixo tem uma mensagem a dizer para actualizar para a última build do Windows 10 que o tempo de suporte está a chegar ao fim!
Acho que a limpeza de metro apps provocou esse problema. Não sei se poderá ser o teu caso. O Windows 10 é formado por módulos e qualquer coisa pode ser removida, até o defender pode, mas depois se isso vai causar problemas futuros numa actualização já é outra história.
Por isso neste meu caso fico na mesma situação que tu, só que tenho acesso ao desktop sem problemas alguns mas não faz a actualização como já disse acima.
Há duas aplicações free, para os users pessoais que não empresas, que podem ser usadas para instalar o Windows a partir do desktop doutro Windows fazendo a maior parte do trabalho: Win to USB e Win to HDD.
WintoUSB:
https://www.easyuefi.com/wintousb/
WintoHDD:
https://www.easyuefi.com/wintohdd/index.html
Nota: Para instalares o Windows usando uma dessas aplicações tens que ter acesso ao desktop e tens que ter outro disco ou uma partição nele para puderes fazer isso. Depois é só arrancar por esse disco e completar o resto dos passos finais antes do desktop do Windows.
O WinToUSB é para instalar o Windows para discos externos. Se tiveres um podes sempre usar para instalares o Windows e depois dentro desse usa o WintoHDD para instalares na tua máquina em que tens problemas. terás que formatar o disco antes de instalares com a aplicação claro está.
Nota 2: Tens que ter uma imagem ISO do Windows 10. a tool do Windows, media creating tool, permite criar uma imagem ISO do Windows para além de permitir criar uma pen de Boot mas tem que ser imagem ISO para o WintoUSB ou WintoHDD poderem usar para instalar o Windows de forma auto.
Já os usei muitas vezes e funcionam 5 estrelas.