provavelmente tens que fazer upload dos templates para o servidor e só depois instalá-los a partir do painel de administração do Joomla
quanto ao dominio vs subdominio, é lógico que o dominio tem certas vantagens. não a nivel técnico provavelmente, mas a nivel do utilizador.
porque o utilizador vê um site chamado diogo.freehostia.com (diogo é um nome aleatório) e vê outro chamado diogo.com, qual é que achas que dá mais credibilidade? ainda mais com o nome FREEhostia que para quem não conhecer assume logo à primeira que é gratuito (o que pode não ser o caso)
além disso, como tu disseste e bem, só pensas comprar dominio quando tiveres mais sucesso.
lá está. então uma pessoa mais entendida (que pelo menos saiba a diferença entre subdominio e dominio) vai talvez assumir que o site que tem dominio próprio pertence a uma pessoa/empresa que já tem mais sucesso e experiencia.
