Por causa dos engraçadinhos que passam o tempo a dizer mal do windows (e a querer mal)... toda a gente quer fazer um virus para "lixar" alguém ou para manchar o nome da Microsoft.
Teoria da conspiração:
Há também as empresas que vendem os AV, claro, se não houver vírus, não há vendas
Linux é free não interessa fazer-lhe mossa.
Mac é uma minoria do mercado... por isso também a quantidade de vírus é proporcionalmente menor.