Tens o OSCommerce e o ZenCart como duas boas soluções. No entanto para que consigas por tudo a funcionar necessitas de ter alguns conhecimentos de PHP pois ambos usam essa linguagem de programação.
Se queres ter apenas uma loja online básica, então qualquer um deles serve. Se queres costumizar a tua loja, então o OSCommerce torna-se um pouco complicado pois não tem sistema de templates de origem e a maior parte das contribuições altera o código fonte o que quando se quer fazer um update se torna muito complicado.
Por acaso tenho esse instaldo mas acho que tem um defeito (mais provavelmente sera ignorancia minha) por exemplo se quiser vender t-shirth`s nao tem a opcoa pra meter os varios tamanhos. isto e para o comprador escolher entre S, M, L, Xl. e mesmo assim ou esta-me a falhar alguma coisa?