assim sem pensar em coisas dedicadas, precisas de um programa que te grave o input da placa de som do pc, depois a passagem para MP3 pode ser feita aparte.
há tempos tive de fazer uma coisa semelhante, mas a partir de um gravador...
procurei no google por "free sound recorder software" ou qualquer coisa assim.
arranjei um (cujo nome não me lembro), que depois de gravar o som, me permitia fazer cortes e fades no som, e depois gravar no formato que quisesse.