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Dúvida sobre [email protected]

Discussão em '[email protected]' iniciada por Babuchka, 24 de Julho de 2005. (Respostas: 11; Visualizações: 763)

  1. Boas:

    Recentemente tive conhecimento deste Projecto, por um e-mail q m enviaram :rolleyes: + vale tarde q nunca!!!

    Parecendo-me um Projecto válido 'tou a pensar aderir, ou seja, juntar-me aos bons para ser como eles :001:
    E como tal... Surgem dúvidas, se tiverem paciência para m aturar ;)

    Assim, no cliente gráfico (começar devagar, para chegar longe) o que significam os átomos azuis, vermelhos cinzento, etc., isto é, se tem algum significado.

    Onde se consegue informação sobre as proteínas que estamos a foldar?
    Por ex.: "p889_p53dimer889" diz respeito a quê? é sobre o quê?

    Para já ficava por aqui.

    cps
     
  2. shello

    shello Moderador
    Staff Member

    Boas!
    É com toda o nosso entusiasmo que te recebemos aqui no projecto!
    E vamos começar a responde Às dúvidas.
    As cores dos átomos correspoendem a elementos diferentes, não sei dizer quais, mas não é muito relevante, pelo menos para mim.
    Pode-se ir buscar informações sobre a proteina que se está a foldar em http://vspx27.stanford.edu/psummary.html

    http://vspx27.stanford.edu/cgi-bin/allprojects Esta página mostra informações mais detalhadas sobre os projectos.

    Espero ter ajudado
    Abraços, keep folding!
     
    Última edição: 24 de Julho de 2005
  3. Pocas

    Pocas 1st Folding then Sex

    Conselho de Amigo: Vai po cliente Consola! ;)

    Pocas
     
  4. Gleed

    Gleed I fold therefore I AM

    Pode-se ir buecar informações, e depois sou eu :lol:

    Vem vindo ao nosso cantinho, se quiseres aparece tb no irc que estamos por lá, para ajudar no que necessitares

    abraço [​IMG]
     
  5. Agradecimento :009:

    Viva:

    Obrigado pela pronta resposta e pela recepção.

    Verifiquei os links que m indicaram, no entanto não encontrei nenhuma referência à proteína "p889_p53dimer889" se alguém puder ajudar... fixe.

    Vou seguir o teu conselho Pocas, mas... deixa-m digerir este primeiro contacto :wow:

    Tenho lido algumas threads e vi q conseguem foldar as proteínas em pouquissimo tempo.
    Pergunto: é normal ter uma proteína com 5000 frames e demorar 6d 12h 23' (Eu sei q a minha máquina n é grande coisa, mas...).

    Sem + e agradecendo a atenção.

    [[[[]]]]'s
     
  6. kingdom

    kingdom 1st Folding then Sex


    Bem demorar 6 dias a foldar uma proteina de 5000 frames não é lá muito normal pelo menos cá por casa....A verdade é que tambem tenho um P4 3.0 [email protected] 512Mb DDR400 e uma GeForce FX5200....quanto ao teu PC não sei....mas pelo menos aqui não demora assim tanto tempo...

    Já agora, bem-vindo ao projecto...

    Cumps
     
  7. mariocunha

    mariocunha I folded Myself

    Se vires bem está lá vale 272 pontos.

    http://vspx27.stanford.edu/psummary.html

    Keep Folding
     
  8. Pocas

    Pocas 1st Folding then Sex

    Eu aqui tb é +/- uma semana pa foldar uma prota... mais dia menos dia... n deixo o pc ligado de noite... faço algumas coisas que gastam cpu... mas contribuo na mesma!

    Pocas
     

  9. Boa Tarde,

    Não sei se isso ajuda, mas este projeto p889 etá estudando a proteína p53, nossa principal linha de defesa contra mais de 50% dos tipos de câncer. Estão a estudar esta proteína a exaustão sobre as mais diversas condições.

    Não te assuste com o tempo que o programa mostra que vai levar para terminar esse trabalho pois isto varia de acordo com o tempo que você deixa o programa do Folding trabalhar. Portanto ainda vai variar muito.

    Se ainda te interessa conhecer um pouco mais sobre a p53 e o trabalho que o pessoal de Stanford tem feito sobre ela (com a nossa ajuda, é claro) visite este link, aonde tem um resumo sobre ela, embora que, para ter acesso a todo o trabalho é preciso se associar ao site em questão.

    Aquele abraço.
     
  10. Boas:

    Thks Fernando_Celio, era precisamente do q andava à procura, pq se repararem em http://vspx27.stanford.edu/psummary.html, ao clicar em "description" leva-nos a "all projects" e aí não é referida a p889, daí a questão, + 1 vez obrigado pelas dicas.

    Claro q a velocidade d processamento é relativa, depende de muitas coisas, só coloquei a questão para fazer 1 ideia, ñ estivesse isto mal cfg...

    Claro q isso ñ vai fazer com q deixe de colaborar, ñ é depressa... é + devagar, se o prazo é de 54 dias, conto acabar bem a tempo. ;)

    Sobre as cores dos átomos, deixo aqui um pequeno apontamento, para aqueles que se interessam por essas coisas:

    "... os átomos de carbono são apresentados em cinza claro (apesar de que alguns átomos de hidrogénio nem serem apresentados), os átomos de oxigénio aparecem a vermelho, os átomos de nitrogéneo aparecem em azul e os átomos de enxofre aparecem em amarelo".

    Para terminar gostava de agradecer o empenho q o ppl tem demonstrado para satisfazer a minha curiosidade de newbie, o q tem cimentado a minha vontade de colaborar no Projecto.

    cps
     
  11. shello

    shello Moderador
    Staff Member

    Por mim, sempre que precisares de ajuda, tento ajudar no que posso ;)

    Abraços!
     
  12. Dazkarieh

    Dazkarieh To fold or to FOLD?

    Bem..vou começar o desenterranço de threads após a minha ausencia ;) Aproveito para mandar um grande abraço a todos :)

    Bem vindo, Babuchka. espero que te mentenhas conosco durante muito tempo.

    A tua duvida é muito boa e o Fernando_Celio respondeu muito bem. Estamos a ver se arranjamos um tempinho para termos a resposta a esse tipu de perguntas no site..e com o tempo lá vamos :)

    Qualquer duvida..não hesites :)

    [[[[ ]]]]
     

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