1- Basta meter o index em html ?
2- Através do ftp o que tenho de enviar para o serv ?
O index + o resto dos swfs ?
1- Se o site for todo no tal swf só precisas de metê-lo no index.
2- Envias tudo o que necessitas para o site correr (páginas html, swf, imegs páginas php, ... o que for)