1. Este site usa cookies. Ao continuar a usar este site está a concordar com o nosso uso de cookies. Saber Mais.
  1. Manuela Alves

    Manuela Alves I quit My Job for Folding

    Bom Dia
    Tenho estado com problemas no computador, que me obrigaaram a interromper o folding 24/7. Estão mais ou menos resolvidos e passaram pela desinstalação do Norton e instalação do AVG free, Comodo Firewall Pro e Spyware Terminator. Ao pretender retomar o folding veifiquei que está encravado:
    [07:33:18] [email protected] Gromacs Core
    [07:33:18] Version 1.90 (March 8, 2006)
    [07:33:18]
    [07:33:18] Preparing to commence simulation
    [07:33:18] - Ensuring status. Please wait.
    [07:33:35] - Looking at optimizations...
    [07:33:35] - Working with standard loops on this execution.
    [07:33:35] - Previous termination of core was improper.
    [07:33:35] - Going to use standard loops.
    [07:33:35] - Files status OK
    [07:33:35] - Expanded 78901 -> 420497 (decompressed 532.9 percent)
    [07:33:35]
    [07:33:35] Project: 2124 (Run 274, Clone 32, Gen 17)
    [07:33:35]
    [07:33:35] Entering M.D.
    [07:33:56] (Starting from checkpoint)
    [07:33:56] Protein: p2124_lambda_5way_melt_4_10011
    [07:33:56]
    [07:33:56] Writing local files
    [07:33:56] Using table 3
    [07:33:56] Writing local files
    [07:33:56] Completed 0 out of 20000000 steps (0)

    Na pasta work existem diversos ficheiros relativos a esta unidade mas alguns têm 0 bytes.

    Uso o modo consola, oculto pelo Hideit, e o FahMon 2. 1.5

    O que está errado e como posso corrigir?
    Obrigada
     
  2. grandenaboverde

    grandenaboverde O Senhor dos Bolinhos

    sempre que isto aparecer, fecha a consola e volta a abrir.

    como ele encontrou problemas de instabilidade, quando volta a correr desactiva as optimizações todas. o que torna o folding extremamente lento..
     
  3. Manuela Alves

    Manuela Alves I quit My Job for Folding

    Obrigada pela ajuda. Segui as instruções.
    Será que já está tudo bem?
     
  4. Manuela Alves

    Manuela Alves I quit My Job for Folding

    Obrigada pela ajuda. Segui as instruções.
    Será que já está tudo bem?
    Launch directory: C:\Programas\[email protected]
    Executable: C:\Programas\[email protected]\FAH504-Console.exe


    [12:55:51] - Ask before connecting: No
    [12:55:51] - Use IE connection settings: Yes
    [12:55:51] - User name: www.pplware.com (Team 35271)
    [12:55:51] - User ID: 42181D9B6CA376E3
    [12:55:51] - Machine ID: 1
    [12:55:51]
    [12:55:51] Loaded queue successfully.
    [12:55:51] + Benchmarking ...
    [12:55:54]
    [12:55:54] + Processing work unit
    [12:55:54] Core required: FahCore_78.exe
    [12:55:54] Core found.
    [12:55:54] Working on Unit 04 [January 25 12:55:54]
    [12:55:54] + Working ...
    [12:55:54]
    [12:55:54] *------------------------------*
    [12:55:54] [email protected] Gromacs Core
    [12:55:54] Version 1.90 (March 8, 2006)
    [12:55:54]
    [12:55:54] Preparing to commence simulation
    [12:55:54] - Looking at optimizations...
    [12:55:54] - Files status OK
    [12:55:54] - Expanded 78901 -> 420497 (decompressed 532.9 percent)
    [12:55:54]
    [12:55:54] Project: 2124 (Run 274, Clone 32, Gen 17)
    [12:55:54]
    [12:55:54] Assembly optimizations on if available.
    [12:55:54] Entering M.D.
    [12:56:15] (Starting from checkpoint)
    [12:56:15] Protein: p2124_lambda_5way_melt_4_10011
    [12:56:15]
    [12:56:15] Writing local files
    [12:56:15] Using table 3
    [12:56:16] Completed 202040 out of 20000000 steps (1)
    [12:56:16] Extra SSE boost OK.
     
  5. shello

    shello Moderador
    Staff Member

    Não vejo qualquer problema nesse log :)
    Parece que está tudo bem agora!

    :kfold:
     
  6. Manuela Alves

    Manuela Alves I quit My Job for Folding

    Vai lentinho mas vai indo
    [12:55:54] + Working ...
    [12:55:54]
    [12:55:54] *------------------------------*
    [12:55:54] [email protected] Gromacs Core
    [12:55:54] Version 1.90 (March 8, 2006)
    [12:55:54]
    [12:55:54] Preparing to commence simulation
    [12:55:54] - Looking at optimizations...
    [12:55:54] - Files status OK
    [12:55:54] - Expanded 78901 -> 420497 (decompressed 532.9 percent)
    [12:55:54]
    [12:55:54] Project: 2124 (Run 274, Clone 32, Gen 17)
    [12:55:54]
    [12:55:54] Assembly optimizations on if available.
    [12:55:54] Entering M.D.
    [12:56:15] (Starting from checkpoint)
    [12:56:15] Protein: p2124_lambda_5way_melt_4_10011
    [12:56:15]
    [12:56:15] Writing local files
    [12:56:15] Using table 3
    [12:56:16] Completed 202040 out of 20000000 steps (1)
    [12:56:16] Extra SSE boost OK.
    [13:53:35] Writing local files
    [13:53:35] Completed 400000 out of 20000000 steps (2)


    Não dá para ver se as optmizações estão a ser consideradas, pois não?
     
  7. shello

    shello Moderador
    Staff Member

    Quanto a optimizações (forçar ASM (Assembly code)), vejo o "Extra SSE boost OK.", ou seja, estão a ser usadas as instruções assembly para processar a WU.
     
  8. WindWalker

    WindWalker Power Member

    Dá. Usando a flag "-verbosity 9", sabes o máximo possível de informações (=>FAHlog.txt) sobre a execução do [email protected]
     
  9. Manuela Alves

    Manuela Alves I quit My Job for Folding

    Obrigada pela ajuda e sugestão da "flag" . Fui ver ao tópico "tudo ...em 5 minutos mas não me vou meter em aventuras que podem estragar o que agora está a funcionar bem. Depois de 2 dias de arrelia a compor o que tinha estragado (nada relacionado com o folding), não me quero meter noutra tão cedo...
     

Partilhar esta Página