Hmmm. Nunca usei outra GPU, por isso é complicado saber se são tempos normais ou não, mas aqui, um FahCore 17 demora entre 6 a 12 horas, dependendo do tamanho. Também recebo as vezes uns FahCore 18, que aparentemente são apenas para Windows + NVIDIA, e as ETA's são mais ou menos iguais.
Já sugeri isso a alguém aqui, não me lembro a quem, mas vejam se os vossos drivers são os melhores para folding. Por exemplo, com as minhas GTX 770 a produção cai para metade se usar o driver mais recente. Uma pesquisa no google por "[placa grafica] folding drivers" pode dar uma ajudinha a encontrar o melhor driver.