Vê a minha photoreview sobre o F3Ja, e vês logo o quanto é que a bateria fica de fora. É pouco menos de 2 cm, pelo que cabe perfeitamente numa mala de portátil normal.
Quanto a desempenho, HÁ diferença. Os primeiros modelos do F3Ja (os AP212H) tinham uma bateria de 6 células (que não sai para fora) e rapidamente foram substituidos pelos modelos com bateria de 9 células (AP003H) exactamente por causa da autonomia.
Ainda não vi em lado nenhum nenhuma referência da autonomia da bateria do S1 pro (6 células), e normalmente isso não é bom. Quem tiver um S1 pro podia escrever umas linhas sobre isso. Se decidires comprar uma bateria de 9 células para o S1 pro, ela sai-te para fora exactamente como a do ASUS.
Pela minha experiência com o F3Ja, a correr Freehand e Photoshop só com bateria e em modo de High Performance (o F3Ja tem modos de desempenho diferentes), a bateria de 9 células durou-me 2h30 e ainda tinha carga quando o desliguei. Se trabalhares em CAD, que puxa mais pelo processador, eu estimaria que te durará umas 2h.
Ligados à corrente, e para uso de programas como Photoshop, eles devem ter desempenhos muito parecidos, já que o Photoshop puxa mais por disco e processador (que são idênticos em ambas as marcas).