Acho que tens de instalar o Folding com o teu nick e número da equipa igual nos dois e depois um dos pc's tem de ser console 1 e o outro a console 2.Acho que para configurares isto tem de ser nas definições
Corrijam-me se tiver errado
Abraço
Como são máquinas diferentes, não interessa o nome ou a MachineID. Isso só é relevante em máquinas com Dual Core e/ou HT.
Como disse o _Rock_, apenas tens de instalar com as mesmas configurações que instalaste na primeira máquina.
Podes também dar uso às flags consoante a máquina que tens
Dá uma olhadela a esta thread e se tiveres alguma dúvida é só perguntares