Boas xplor
Esclarecendo uma coisa, MabLab e Mathematica são 2 software's e não duas linguagens, onde nestes escreves programas/ funções no qual a sintaxe se assemelha ás linguagens ditas Imperativas( C,JAVA,PASCAL,....).
Já trabalhei com os 2 e ambos são muito bons, gosto mais do mathematica pois trabalhei ( e ainda trabalho, na vertente de calculo de probabilidades) com ele mais tempo, e quando trabalhei com o MatLab foi para cálculo numérico (onde este é muito bom) e não gostei muito por causa da matéria que estava a abordar.
Agora tudo depende no que consiste o trabalho, tenta ver qual deles se adequa mais.
cumps