Se tens um slot AGP8x e só queres mudar a gráfica, estás melhor servido com uma gráfica AGP, tudo o que há para PCIe que valha a pena também tem uma versão AGP, pelo menos por agora.
Versões do socket 478 com PCIe, talvez exista, ouvi falar de um chipset da SIS, mas a performance não é grande coisa.
PCIe, para quem não quer um upgrade mais geral, não trás qlqr vantagem de desempenho neste momento.