Eu prefiro céus com nuvens. Acho que sem nuvens fica um bocado monótono.
Mas também depende do objectivo da fotografia. Nessa em particular, prefiro com.
O que eu costumo fazer, caso esteja céu limpo ao nascer/por do sol, é fotografar a favor. Apesar de não ter nuvens, fica com umas cores bastante interessantes (cinto de venus).
Acabei por ainda não voltar a Amarante! A ponte já tinha luzes? Umas semanas antes não tinha :-(