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Newsletter [email protected] - Nº 2

Discussão em '[email protected]' iniciada por shello, 20 de Novembro de 2005. (Respostas: 31; Visualizações: 3010)

  1. shello

    shello Moderador
    Staff Member

    Newsletter nº2 - 20 de Novembro a 3 de Dezembro de 2005
    [​IMG]

    Newsletter feita com a participação de (por ordem alfabetica):
    Albumina; Dazkarieh; El_UnO; Fontemourisca; HecKel; _Rock_; shello; The_7
    Agradecimentos (sem ordem especial) a:
    Metro; ZoomBang

    Mensagem
    Esta 2ª Newsletter saiu, mas saiu orfã.
    Durantes estes últimos dias, fomos sentindo muito a falta do nosso coordenador, pelo que foi dificil o trabalho sem este amigo. A realidade é que a sua ausência (esperemos que temporária, e por muito pouco tempo) é um vazio muito grande na equipa, vazio esse que é impreenchivel.
    Fazemos votos pelas rápidas melhoras e suspiramos pelo regresso quanto antes do nosso foldador, coordenador e (mais que tudo) amigo Dazkarieh.

    by: shello e Albumina


    Curtas [email protected]
    16 Nov - Foram "descobertos" dois novos sites de estatísticas do [email protected]:
    http://www.rage3d.com/folding/stats.php (por Metro)
    http://www.statsman.info/folding2stats/ (por DekkeR)
    Ambos os sites disponibilizam vários dados estatisticos sobre as várias equipas.
    Fonte: http://www.techzonept.com/showthread.php?t=76517

    13 Nov - O Google Compute desassocia-se do [email protected]; segundo Vijay Pande não haverão novas versões do Google Compute, no entanto as antigas continuarão a funcionar.
    Fonte: http://www.techzonept.com/showthread.php?t=76177

    07 Nov - Cura Nanotecnológica para o cancro - Segundo um artigo da Wired News
    Fonte: http://www.techzonept.com/showthread.php?t=75834
    Artigo: http://www.wired.com/news/medtech/0,1286,69206,00.html?tw=wn_4techhead

    05 Nov - A FAQ das doenças estudadas foi actualizada para incluir os mais recentes progressos nas diversas áreas.
    Fonte: http://folding.stanford.edu/news.html

    29 Out - BlueGene/L da IBM bate o seu record - Um artigo interessante que além de falar do BlueGene/L da IBM também faz uma referência "histórica" ao [email protected] e ao [email protected]
    Fonte: http://www.techzonept.com/showthread.php?t=75102
    Artigo: http://arstechnica.com/news.ars/post/20051029-5495.html

    18 Out - A versão 5.04 BETA da consola para Windows e Linux está disponível na página de downloads de Stanford ( http://folding.stanford.edu/download.html ), coisa que (ao que parece) antes nunca tinha acontecido: disponibilizarem para download uma versão BETA da consola na página principal (normalmente era posta numa página à parte).
    É de ter em atenção que a versão é BETA, logo pode ter erros e podem ocorrer problemas.
    Fonte: http://www.techzonept.com/showthread.php?t=76824

    by: HecKel


    Iniciativas [email protected]
    Material de Divulgação
    Já podem encomendar o novo porta-chaves (ao pescoço). É um excelente meio de divulgação.
    Visualização e instruções para a sua aquisição em:
    Http://www.techzonept.com/showthread.php?t=63398

    [email protected] Work Art
    Graças ao notável engenho de alguns dos nossos foldadores, continua dinâmica esta thread onde se trabalha a imagem da nossa comunidade.
    Participem, nem que seja com a vossa opinião, ou coloquem as vossas ideias.
    Fonte: http://www.techzonept.com/showthread.php?t=63064

    Newsletter
    Podem e devem enviar artigos que considerem interessantes para divulgar através deste meio, bastando para isso enviar um e-mail para:
    [email protected] .
    Fonte: http://www.techzonept.com/showthread.php?t=74252

    Carta de Apresentação do [email protected]
    Está em discussão a minuta de uma Carta de Apresentação do projecto a que todos pertencemos. A intenção será usá-la como primeira abordagem a empresas, escolas e universidades e outros potenciais usuários.
    A ideia é “uniformizar” os contactos da comunidade embora seja compreensível a personalização da mesma mediante o remetente e o destinatário.
    Contribuam com a vossa opinião em:
    Fonte: http://www.techzonept.com/showthread.php?t=76557

    by: Albumina


    Noticias [email protected]
    Novas T-Shirts [email protected] 2006
    Após o grande sucesso das T-Shirts deste ano, a [email protected] tomou a iniciativa de criar o novo modelo para 2006.
    Neste preciso momento, está a decorrer uma votação para escolhermos o novo modelo, por isso contamos com a vossa participação para darem opiniões e/ou sugestões para o novo logotipo. Os novos trabalhos poderão ser entregues até 15 de Dezembro; depois dessa data, e até ao fim do ano, será escolhido o novo logotipo para as t-shirts.
    Para poderem estar a par desta iniciativa podem vir ao nosso fórum, na seguinte thread: http://www.techzonept.com/showthread.php?t=75606

    [email protected] no Frappr
    Para quem desconhece, o Frappr é um site onde se pode criar grupos e através do qual podemos saber a localização de cada membro do grupo.
    A [email protected] também já criou um grupo para podermos saber a localização dos muitos foldadores que já possuímos espalhados por Portugal. Para se poderem juntar ao grupo, basta seguir o seguinte link: http://www.frappr.com/portugalatfolding
    No meio da página, encontra-se uma caixa a dizer “Add yourself”
    -Escreva o seu nome ou nick no campo do “Name”
    -Depois terá de clicar no campo “Not in the US? Click here!” o campo em cima irá mudar para “City” onde colocará o nome da sua cidade e em baixo irá aparecer uma lista com diversas cidades onde terá naturalmente de escolher a sua. Se por acaso a sua não aparecer, tente a mais próxima de si. NOTA: Por vezes a lista demora um bocado a aparecer!
    -No campo “Shoutout” poderá escrever uma pequena mensagem que será vista por todas os que visitarem a página.
    -Por fim poderá enviar uma pequena foto que o/a caracterize .
    Dê uma vista de olhos, e junte-se a nós!

    Nós no Hi5!
    Para além do fórum, do IRC e do Frappr, a [email protected] tem mais locais de encontros, neste caso o hi5 ( www.hi5.com ).
    Para quem desconhece, o Hi5 é um site onde qualquer um se pode registar e poderá fazer uma apresentação de si mesmo, tal como a data de nascimento, localização, gostos pessoais etc. e a partir daí reencontrar antigos amigos ou mesmo fazer novos amigos.
    No Hi5 também se pode criar grupos e óbviamente a [email protected] não ficou para trás! Fizemos então um grupo para dar a conhecer os diversos membros foldadores da [email protected]
    Depois de efectuar o registo, poderá aceder ao grupo da [email protected] através deste link: http://www.hi5.com/friend/displayGroup.do?groupId=386771 .

    by: _Rock_


    Dicionário [email protected]
    Apesar da complexidade do tema, pretende-se aqui dar uma pequena ideia daquilo que é ao fim ao cabo o verdadeiro objecto de estudo deste nosso projecto.

    Proteína = deriva do grego proteíos = “que tem prioridade” = “o mais importante”.

    As proteínas são bio moléculas (compostos químicos muito complexos), sólidas e incolores, que se encontram em todas as células vivas.
    Todas possuem altas percentagens (variáveis dependendo do tipo de proteína) de Azoto, Oxigénio, Hidrogénio e Carbono, na maior parte existe ainda Enxofre e em algumas Fósforo, Magnésio, Ferro e Cobre entre outros elementos.

    São sintetizadas pelos organismos vivos através da condensação de um número grande de pequenas moléculas de aminoácidos e a sua diferenciação é feita pela sequência pela qual os aminoácidos se organizam.
    A sua estrutura espacial pode ser:
    primária: cadeia de aminoácidos em linha;
    secundária: cadeia em hélice ou em forma de zig-zag;
    terciária: conformação globular;
    quaternária: união de várias cadeias com estruturas terciárias.

    As proteínas desempenham muitas funções biológicas, entre elas:
    - as enzimas,
    - as hormonas (ex.: a insulina)
    - as proteínas transportadoras (ex.: hemoglobina que transporta o Oxigénio),
    - as proteínas de movimento (ex.: actina e miosina presentes no sistema contráctil dos músculos),
    - as proteínas estruturais (ex.: colagénio nas cartilagens e tendões e a queratina nas unhas e cabelo),
    - as proteínas de defesa (ex.: leucócitos ou glóbulos brancos), entre muitas outras.

    As principais fontes de proteínas são a carne e o peixe, os ovos, os lacticínios (leites, queijos e iogurtes), as leguminosas (feijão, soja, lentilha), os cereais (arroz, aveia, milho, trigo, etc.) e sementes e frutos secos (sésamo, nozes, amêndoas, etc.).

    by: Albumina


    Os "verdinhos"
    Aqui estão os “verdinhos” desta quinzena. Pessoas que tiveram um rasgo de bom senso e aderiram à causa do momento. Aqui vai a lista dos 56 (se o sono não me tolheu o espírito) com os comentários da praxe!

    Uipe
    Joao_Taborda
    DiogoSanches - Sigam o exemplo deste jovem [PUB] Visitem o [email protected] [/PUB]
    J.Raimundo
    Bzook
    4d1ct3d
    www.cebola.pt - Imagino o teu hálito logo de manhã
    joao_costa
    Variavel - Nunca hás-de ficar Constante
    nao_querias_mais_nada - Ao contrário do que possa parecer é um nick, não um comentário meu
    CaJuN
    ViBe_99
    Rodrigo_Moreira
    www.the-onix.com - Viciados
    marshal
    curacancro - Ora aqui está uma pessoa imbuída no espírito da coisa
    Almeida
    jmachado
    Lanzu
    morg2k2
    hardware.com.pt - Novo team com gajos já repetidos (não é GLV aka Good) mas o que interessa é foldar
    _kermit_the_frog_ - Sabias que saiu um novo filme dos marretas
    Tiago_Silva
    SIR_Arrentela
    Sckauter - Mais um visitante assíduo do [email protected] (é só pessoas simpáticas e inteligentes lá)
    bang_pt
    ElrOnD_TehczPT - Aí meu Deus que me enganei outra vez no nick (sou mesmo distraído)
    Tyler_Durden
    Sway
    hcp
    Paulo_da_Silva
    X3non - Ver comentário ao Sckauter
    RedShark
    osga - Nós também temos respeito por pequenos animais rastejantes que foldam (até aceitamos políticos imagina)
    Gocho
    jay
    Vania
    Henrique_(Chuo)
    ngsousa
    Black_Knight
    Fuadass - Eu podia fazer um comentário mas já disseste tudo
    Hugo_Alves
    www.grafe.pt - Quando for preciso um anúncio na TV já temos voluntário
    PiCColinY - Epá, um colchão a esta hora vinha mesmo a calhar
    Mirian_Hong
    Conde
    nuieee_FEUP - Once more FEUP ROCKX
    http://msource.dyndns.org/
    Sephiroth
    gendo
    Ricardo_Alberto
    jorge
    ATP-m
    Manaia
    Helio
    lip

    by: Fontemourisca


    Nome de de código: "Produtividade"
    Mais uma quinzena, mais uns concorrentes, e os de hoje são...
    Bem, vamos lá falar de coisas sérias…
    Como na quinzena passada, alguns tiveram de ser os escolhidos e a história repete-se.
    O folding é “aquela base"… Tão a ver ideia? Precisa de pessoal empenhado, não de molengões como eu, que vêm para aqui, sentam o rabo na cadeira, ligam um programa e “puff” faz-se folding… O FOLDING PRECISA DE PESSOAL à séria, homens e mulheres de barba rija… LOL… ok… tava no gozo… esqueçam lá isso.
    E os mais produtivos desta semana sãooo:
    amigos_da_proteina
    funkyfolders
    www.virtual-fusion.com
    www.ViPeR5000.net
    www.*****.pt
    www.overvoltage.pt
    ch-informatica.com/forum
    Silence
    www.extreme-computers.pt
    www.*****.com

    by:The_7


    Especial: Tutorial "Penfolding"
    Deixem-me referir, em jeito de introdução, que este tutorial seria extremamente simples caso não introduzíssemos uma particularidade, ou seja, para foldarmos numa Pendrive num PC com Internet, apenas teríamos de:

    1º - Colocar uma consola numa qualquer pasta na pendrive;
    2º - Correr a consola e configurá-la de acordo com as instruções neste link http://www.techzonept.com/showthread.php?t=55095
    3º - Deixá-la correr mesmo a partir da Pen (não é necessário passar para o disco do PC)

    No entanto, há um factor que se afigura adverso quando queremos foldar noutros PC’s, que é o facto de eles às vezes não terem Internet disponível. Este factor, bastante irritante, pode no entanto ser ultrapassado da maneira que a seguir explicamos:

    [​IMG]

    1º - No nosso computador, em casa, e que temos já a foldar (temos, não temos?) com ligação à Internet, criamos uma pasta para uma consola diferente, por exemplo, Consola2;

    2º - Configuramo-la, conforme link já fornecido mais acima, indicando, no entanto, um MachineID diferente do da consola já existente no vosso PC (isto evita que descarregue a mesma WU), no caso concreto foi utilizado o nº 2;
    3º - No final, ela descarrega uma WU e inicia o foldanço. Podem fechar a consola e transferir a pasta Consola2 para a vossa Pendrive;
    [​IMG]

    4º - Todos os PC’s onde tentamos foldar pela 1ª vez, tentam conectar-se ao servidor durante apenas uns instantes para atribuir um ID (diferente do MachineID que falámos anteriormente). Se não conseguir (por falta de ligação Internet), nem sequer inicia o trabalho de foldar, no entanto, podemos “enganar” a consola fazendo-a pensar que está em casa a foldar no nosso PC;

    5º – Para isso, abrimos a janela “Executar” no menu Iniciar, conforme a figura e escrevemos a palavra regedit e confirmamos em OK;
    [​IMG]
    6º - Em seguida abre uma janela e vamos procurar o seguinte caminho (pasta) HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\PandeGroup\[email protected], e clicamos em cima dela com o botão direito do rato, escolhendo de seguida “Exportar” tal como mostra a figura;
    [​IMG]
    7º – Damos um nome ao arquivo (Folding por exemplo) e guardamos esse ficheiro na Pendrive
    [​IMG]
    8º – Antes de começar a foldar no novo PC, executamos o ficheiro “Folding.reg” mesmo a partir da Pendrive e quando nos perguntar se pretendemos adicionar a informação I:/Folding.reg ao registo, nós responderemos SIM.
    Este processo executa-se apenas 1 única vez em cada PC, pelo que se forem foldar passados uns dias nesse mesmo PC, não é necessário repetir o processo.

    9º -...E já está! É só iniciar a nossa consola e começará de imediato a foldar mesmo que não tenha Internet. Quando estiver concluído o foldanço é só arranjar qualquer computador com net, que faça o envio e recepção de uma nova WU

    Espero que vos sirva de incentivo para foldar onde quer que vão!

    Keep Folding!

    by: Fontemourisca


    Assistentes para foldar (parte 2) – Review Fahmon
    Depois do EMIII continuamos a série de reviews, desta vez dedicada ao FahMon. Quem quiser correr o folding numa máquina Linux, preste especial atenção, pois este pequeno programa para monitorizar as proteínas é multiplataforma. Quem usar Windows, continue a ler também pois este programa não fica nada atrás do EMIII, analisado na quinzena passada...

    Muitas informações podem ser encontradas sobre este cliente nos links a seguir:

    Apresentação -> http://www.techzonept.com/showthread.php?t=72253 (contribuição do Dekker)

    Tutorial - > http://portal.portugalfolding.com/artigo.php?artigo=66 (contribuição do Dazkarieh)

    Primeiras impressões
    Ao abrir o nosso cliente do FahMon e depois de adicionar uma (ou mais) consola, o aspecto global é o seguinte:
    [​IMG]
    Clicando no cliente, aparece ao lado a informação referente á proteína que está a ser processada. Como dá para ver na imagem, o aspecto global é bastante simples, o que não põe em causa a funcionalidade do programa, como iremos ver a seguir...


    O FahMon utiliza um código de cores muito fácil de compreender (aparece naquele pequeno quadrado colorido, em cada linha), com o seguinte significado:
    Vermelho: O cliente não foi encontrado ou faltam ficheiros essenciais na pasta onde o cliente está instalado
    Laranja: O cliente foi encontrado mas aparentemente está inactivo. O cliente pode estar parado ou simplesmente o processador pode estar a ser utilizado noutras tarefas e portanto, o folding fica em idle até o processador ficar livre.
    Verde: Está tudo a funcionar e o FahMon deve mostrar correctamente toda a informação referente á proteína que está a ser foldada, desde que a base de dados esteja actualizada...

    O FahMon utiliza uma base de dados local para mostrar as informações das proteínas, que convém actualizar de tempos em tempos:
    [​IMG]

    [​IMG]

    Configurações
    Clicando em FahMon -> configuration, obtemos mais algumas opções interessantes:
    [​IMG]
    • Enable system tray icon: Minimiza o FahMon para o system tray.
    • Collect .xyz files: Estes ficheiros permitem que aplicações externas façam a simulação 3D da proteína. Ao seleccionar esta opção os ficheiros .xyz são colocados numa pasta “xyz”
    • Auto update projects database when needed: Updates automáticos da base de dados, sempre que surja uma proteína ainda desconhecida pelo FahMon
    • Auto reload every...: Este opção permite alterar a frequência com que o FahMon actualiza o progresso do processamento das proteínas
    • Display ETA as...: Permite alterar o formato usado para mostrar a ETA
    • Use a proxy for HTTP connections: Esta opção permite configurar um proxy para as ligações HTTP do FahMon
    • Proxy requires authentication: Caso o proxy precisar de um login, configurar aqui

    Benchmarks
    Finalmente temos a opção de bechmarks, útil para ver o tempo que leva cada frame (mínimo e médio)
    [​IMG]

    Conclusões

    O FahMon é um programa multiplataforma simples, mas bastante funcional (vai passar a morar no meu pc e tudo ;)  ).

    Para ver os nossos stats pessoais basta carregar em F2 e, em F3, abre uma página do Jmol mostrando uma imagem 3D da proteína...

    Sendo assim, estamos perante uma excelente alternativa ao EMIII, ainda com a vantagem de consumir menos recursos (ocupa 3 megas de ram no meu sistema).

    E para terminar, aqui está uma imagem 3D de uma proteína, gerada pelo Jmol:
    [​IMG]

    by: El_UnO​
     
    Última edição: 21 de Novembro de 2005
  2. shello

    shello Moderador
    Staff Member

    "Stick me, please" :D

    Abraços!
     
  3. Fuadass

    Fuadass I'm cool cuz I Fold

    olha eu :D dass LOL ;D nao e preciso comentar ja agora terminei a pouco a minha 3 wu :D
     
  4. Nemesis11

    Nemesis11 Power Member

    Parabéns.
    Só uma pequena correcção:

    É tutorial.
    Com as letras daquelas dimensões, nota-se bastante o erro.
    Na frase a seguir ao título, a palavra está bem escrita, por isso deve ter sido culpa do teclado. :)
     
  5. shello

    shello Moderador
    Staff Member

    Ups!
    Erro meu mesmo.
    A frase a seguir é um copy paste.
    Peço desculpa a todos.

    Abraços!
     
  6. drmad

    drmad Folding Member

    Stickada. :D

    Ficou muito boa a newsletter (assim como a primeira) mas desta vez consegui-a ver como deve ser toda a preto. :D
     
  7. blueangelman

    blueangelman 1st Folding then Sex

  8. _zZz_

    _zZz_ Professional Folder

    so uma coisa..que aconteceu ao daz? :(
     
  9. DekkeR

    DekkeR Power Member

    Não sticka nada. Aquele 'sistema' de stickies foi criado para não ficar demasiado cheio :P

    O shello criou um tópico com a listagem das newsletters aqui que eu coloquei no sticky 'Comunidade [email protected]' ;)

    Assim fica tudo organizado na mesma e escusa-se de stickar cada newsletter. Sempre que sair uma nova newsletter actualiza-se a thread das listagens e assim ficará à vista de cada um :)

    :kfold:
     
  10. drmad

    drmad Folding Member

    Pronto pronto..

    tira lá de sticky.. :D Não volto a ajudar... :p
     
  11. shello

    shello Moderador
    Staff Member

    :lol::lol::lol:
    luta de moderadores xD

    Abraços!
     
  12. drmad

    drmad Folding Member

    Nopes.. luta de COLABORADORES.. muito pior. :D
     
  13. DekkeR

    DekkeR Power Member

    [offtopic]Estejam calados seus offtopicadores :P[/offtopic]

    Pronto.. assunto resolvido :D
     
  14. Metro

    Metro Benevolent Dictator For Life
    Staff Member

    Eu mandei 3 mails mas pelos vistos a newsletter já tinha sido publicada.

    Nota mental para a proxima edição. Tem que haver revisões do texto. Há umas gaffes pelo meio que teriam sido facilmente evitadas.

    O importante é irmos avançando com a coisa.

    Shello:
    Depois corrige aquilo que sugeri por mail sff. Não queria mexer no post pq se aquilo tem codigo html ainda faço asneira:)

    A ver se na proxima newsletter dou uma ajuda:)
     
  15. HecKel

    HecKel The WORM

    Já agora, existe "hora de tiragem" definida?

    Se fosse acordada uma hora especifica para "lançar" a newsletter poderia-se evitar "informação perdida", bastava ver se já tinha passado da hora para saber se ainda se ia a tempo ;)

    abraços, HecKel
     
  16. shello

    shello Moderador
    Staff Member

    Metro, podias corrigir, visto HTML não ser permitido para nós (nós=eu, pois acho que tu já podes, visto seres moderador.), logo, o post não tem HTML :)
    Mas de qq maneira vou ver o mail :)

    Peço desculpas pelas gaffes :(

    Abraços!

    #edit: HecKel, epá, haver não ha, apesra de tanto a 1ª como a 2ª terem sido enviadas por volta das 20:00
     
  17. _Rock_

    _Rock_ I'm cool cuz I Fold

    Acho que ficou muito bom!! :) Parabens a todos :clap:
    Abraço :kfold:
     
  18. tiagoflg

    tiagoflg What is folding?

    É bem jovens, tou a gostar do vosso trabalho :lol:

    Fora de gozos. Parabéns a todos, ficou bacanita :kfold:
     
  19. Metro

    Metro Benevolent Dictator For Life
    Staff Member

    shello:
    Basta que antes de se enviar ela seja revista por duas ou três pessoas:)
    De resto 5 estrelas.
     
  20. shello

    shello Moderador
    Staff Member

    Sim, metro, eu sei :( esse foi o meu maior erro!
    Obrigado por tudo ;)
    obrigado a todos e principalmente ao The_7 pela pressão exercida (comparação: FasterFox com os servidores :P) sobre mim xD mas ele ajudou mesmo muito. A albumina também foi aquela ajuda super preciosa, e todos os outros que também ajudaram, sem todos estes isto não taria aqui à vista.

    Confesso também que aprendi algumas coisas com esta newsletter :) O que também foi bom para o meu lado "aprendiz disto tudo" :)

    Acho também que é com os erros que se vai lá.

    Abraços!
     

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