O pdftk não é uma programa com comando de converter na página que linkas acima sugerem o ghostscript para fazeres isso →
http://www.troubleshooters.com/linux/gs.htm
O que o pdftk consegue é manipular arquivos com extensão tipo .pdf e secalhar não converte via argumentos a comando pdftk.
Existem maneiras de fazer o que queres como sugerem acima ou com uma ferramenta presente no pacote graphicsmagick chamada gm
gm convert *.pnm output.pdf → comando gm com o argumento convert e * (que signifca todos os arquivos em path com extensão .pnm e uma saída output.pdf) - ou seja se tu na pasta graficos meteres dois ou mais .pnm e apontares o comando lá ele irte-á juntar em um pdf com sequência dos .pnm em ordem crescente presumo - /gráficos/a.pnm , b.pnm ...
$ gm convert ~/gráficos/*.pnm ~/output.pdf → os arquivos a.pnm e b.pnm ficariam no PDF (o ~signifca pasta de usuário do momento)
https://ubuntuforums.org/showthread.php?t=1509964
Também podes usar o convert via pacote imagemagick
$ convert ~/gráficos/*.pnm ~/output.pdf
É possivel que se procurares encontres alguns programas click gráfico para fazer essas funções em modo de script ou algo mas tens de procurar no sourceforge ou comunidades do tipo.