Pode ser excesso de temperatura dentro da caixa o que pode fazer com que a ventoinha do cpu aumente o nº de r.p.m.
Tive um problema destes quando instalei uma fonte a alimentação nova, supersilenciosa, mas como tinha só uma ventoinha de 120 na face junto ao cpu, parte do ar aquecido na fonte ía para o exterior mas outra parte voltava a entrar dentro da caixa, por ranhuras existente na caixa da fonte, no lado oposto.
Resultado: a ventoinha do CPU aumentou de rpm para 5000 para o manter a 54º fazendo uma barulheira infernal.
Solução: tapei com fita as ranhuras da caixa da fonte que davam para o interior da caixa e assim a ventoinha da fonte empurra todo o ar apenas para o exterior.
A ventoinha do cpu ficou a trabalhar a 2500 rpm ficando tudo muito mais silencioso