... se criaste o backup com o time machine, tens só que fazer o clean install, e no momento que estiveres a configurar o teu mac (ja com o mountain lion instalado) ele vai te perguntar se queres migrar a informação, escolhes que sim, apontas para o backup criado no disco externo com o time machine e escolhes que tipo de informação queres migrar (contas de utilizadores, aplicações, definições e outros ficheiros).
outra opção, e configurar uma nova conta de utilizador e depois abrir o "assistente de migração" em /Aplicações/Utilitários, e migrar todos os dados do backup
espero ter respondido à tua questão