Boas, a reparação nunca foi uma opção muito boa a meu ver, e basta estares atento por aqui e noutros fóruns, para veres o pessoal a queixar-se...depois das "reparações" é só pessoal a queixar-se dos mais variados tipos de problemas....para isso mais vale deixar como está e poupar 30 minutos de trabalho.
O melhor que tens a fazer é fazer um backup(e habituares-te a fazer isso regularmente) das coisas mais importantes, ou mesmo de todos os documentos caso tenhas um disco externo ou outro disco....
e depois para rematar--->FORMAT %SYSTEMDRIVE%
Se quando formatares particionares o disco(dividires em 2, uma parte para windows e programas(30gb chega e sobra) e o restante para as tuas coisas) nunca mais tens esse problema.
Abraço