Hum... Ja há algum tempo que nao uso o fireworks mas tenho a ideia que tens que criar o novo "documento" com o fundo transparente, tal como acontece no photoshop.
Depois deve la ser com a ferramenta de gradiente, de opacidade 0% para opacidade 100%, estando lá a cor que queres.
Se não estiveres para criar uma nova imagem, tenta apagar o layer que tens de fundo.
Cumps
#edit: agora que vejo, estava a dar instruções para fundo transparente. Se querias uma imagem com gradiente transparente sobre outra, crias um layer novo e aplicas o gradiente.
Cumps