Eu também tenho uma UPS da APC, contra picos de corrente e serve também de backup durante ~11 minutos quando o Power vai abaixo.
É porreira, mas como dizia o outro, mais vale prevenir do que remediar, por isso quando á trovoada, se não estiver a fazer nada de muito importante, desligo o PC e pronto.
P.S.: O "desligo o PC e pronto", é desligar tudo e retirar a ficha principal dos 220v , porque nunca se sabe !!!