Este parece ser mesmo um ficheiro que não está a ser encontrado. É difícil dizer o que está a acontecer sem mais informação, mas temo que estejas mesmo a resolver de uma forma que não é a melhor a longo prazo. Por exemplo, neste problema de passar o script para o body perdes a separação do código que pode ser útil no futuro (ou até no presente, se já usares o script em mais de uma página).
Podes usar as ferramentas de desenvolvimento do browser (Firefox, Chrome...) para tentar perceber melhor quais são os recursos que não estão a ser carregados e porquê.