Pode ser a gráfica cansada mas também podes testar desactivando a aceleração por hardware no flash: Numa animação flash fazes clique direito, escolhes configurações e no primeiro separador desmarcas a aceleração por hardware.
Reinicias o browser e testas.
Aponto mais para problemas de software que hardware. Tenta com outro browser. A jogar também fica lento, ou a ver filmes directos do disco?
Altera para HTML5 e vê se continua.
http://www.youtube.com/html5
Podes mudar isto quando quiseres. Pode ser que resolva.
Desativa o pepper flash e testa:
http://newtriks.com/2012/12/01/how-to-disable-the-chrome-pepper-flash-player/