Para que queres por antivirus no server 2003? em regra geral o Windows Server 2003 serve para criar e gerir funções de uma rede, desde dominios, acessos, entre muitas outras opções.
Se vais instalar o Server 2003 para uso pessoal, então ai nao interessa se tens o server ou nao, podes instalar o antivirus que te der na real gana.
Isto porque em regra geral as ferramentas que tens no Server chegam e sobram para configurar a segurança, e claro nas empresas o servidor está quase sempre depois de uma firewall fisica correctamente configurada, e nunca com acesso directo ao exterior mas sim atraves de outra maquina, e de uma proxy.
Depende de como o instales e de como o configures.
Melhores Cumprimentos