Isso provavelmente é um problema de hardware... verifica se o disco não tem bad sectors,verifica se não tens nada em overclock no sistema , tipo processador memoria ou timings de memória, podes sempre na bios fazer "load setup defaults" e ver se melhora; podes ainda instalar o SO apenas com o disco , diskettes, leitor cd e placa gráfica e retirar todas as outra placas...