Formatação rápida, ele como diz irá formatar o disco sem analisar cada cluster do disco rígido, dai os dados antigos ainda permanecerem no disco, mas à medida que fores usando ele vai subscrevendo sobre os dados antigos.
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Formatação completa, ele como diz irá formatar o disco analisando cada cluster do disco rígido e pondo-o novamente default (0%), dai demorar mais a formatar.
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Opinião: Penso que é melhor esperares o tempo necessário pela formatação completa, do que executares a formatação rápida e mais tarde andares a te queixar que o computador está lento ou corrompido.
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Recomendado: Formatação completa.