A melhor solução é não usar o sistem restore. É uma porcaria inutil que apenas gasta recursos.
Se queres reparar o windows. Inicia o PC com o cd do windows. E escolhe a opção para instalar o windows, a sehuir aparece uma opção para reparar o windows. Este processo matem o sistema quase intacto, apenas restaura todos os ficheiros originais do windows. No fim é possivel q tenhas d reinstalar algumas drivers.