Sim, uso HyperV para o emulador do Windows Phone.
O Hyper apenas instalado não deve consumir recursos. Enquanto tem uma máquina virtual a correr em cima (com emulador WP por exemplo) dedica processadores/threads para apenas essa máquina virtual e é quase como ter dois sistemas operativos a correr ao mesmo tempo, aí é natural que consuma mais bateria.
Com o portátil só com bateria já estive muitas vezes com o emulador WP a correr (por HyperV portanto) e nota-se uma diminuição da capacidade de bateria. Das 3h que deveria aguentar perde cerca de 1/2h.